Con el fin de salvar al desafortunado Sid, la pandilla se adentra en un misterioso mundo subterráneo, donde tienen algunos enfrentamientos con los dinosaurios, lidian con una enloquecida flora y fauna, y conocen a una comadreja tuerta e implacable cazadora de dinosaurios llamada Buck. Por otro lado, Scrat sigue intentando apoderarse de la escurridiza bellota mientras encuentra el verdadero amor.