Cinco años después de los acontecimientos que sucedieron en Bricksburg, los habitantes deben hacer frente esta vez a una nueva amenaza de proporciones gigantescas: un grupo de invasores Duplo vienen del espacio exterior y lo destruyen todo. La batalla para vencerlos y restaurar la armonía en el universo Lego lleva a Emmet, Lucy, Batman y sus amigos a mundos lejanos e inexplorados, incluida una extraña galaxia donde todo es un musical. Allí se pone a prueba su valentía, su creatividad y sus habilidades de Master Builders.